More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1144 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 386 aa  780    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  48.8 
 
 		 378 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  45.99 
 
 		 400 aa  322  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  49.34 
 
 		 381 aa  302  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.47 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  41.71 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  42.48 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  41.84 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  41.44 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  40.58 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.58 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.58 
 
 		 394 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  40.37 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.68 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  36.82 
 
 		 803 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 		 371 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 377 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.51 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 		 439 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 362 aa  94.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.74 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 517 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 370 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  32.2 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  41.48 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 360 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 436 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  40.33 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>