More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2334 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
376 aa  777    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
414 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0054  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
375 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  37.87 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4086  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 
380 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4235  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0474361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
374 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4210  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
380 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
351 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
372 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
419 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
355 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1153  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.63 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.568345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
467 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
457 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
371 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.54 
 
 
388 aa  89.7  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.91 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
375 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
381 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
458 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.91 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  32.91 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  32.91 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.91 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.91 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  32.91 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
452 aa  86.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
413 aa  86.3  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.94 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.36 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.28 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  28.46 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
770 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  27.24 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
672 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  32.54 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
422 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  26.91 
 
 
935 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  27.94 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
810 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  27.69 
 
 
770 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  27.6 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.9 
 
 
775 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  26.51 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.4 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
748 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  29.95 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  27.55 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>