More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0153 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
381 aa  772    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  48.02 
 
 
372 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  47.76 
 
 
372 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
369 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  48.94 
 
 
400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  45.5 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  38.83 
 
 
386 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
374 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  29.2 
 
 
343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  28.71 
 
 
343 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
374 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  27.22 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
376 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
373 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.44 
 
 
374 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.44 
 
 
374 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.44 
 
 
374 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.44 
 
 
374 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  26.01 
 
 
373 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.44 
 
 
374 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  32.22 
 
 
379 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.36 
 
 
374 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.89 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
419 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  26.59 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  26.59 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.59 
 
 
374 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  25.98 
 
 
373 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  25.68 
 
 
373 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
377 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.28 
 
 
374 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.28 
 
 
374 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  30.84 
 
 
400 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.28 
 
 
374 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
374 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
419 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
408 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
371 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
435 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
370 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
386 aa  96.3  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.14 
 
 
401 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  32.59 
 
 
392 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  25.9 
 
 
364 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
395 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
422 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
390 aa  92  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  28.1 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  32.26 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  30.13 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
464 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  27.21 
 
 
358 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
378 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1256  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121425  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
367 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.36 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.04 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  33.62 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  28.06 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  31.25 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1199  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  26.4 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>