More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3950 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  82.8 
 
 
372 aa  635    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
372 aa  771    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  54.45 
 
 
375 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  48.67 
 
 
369 aa  355  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  48.02 
 
 
381 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  46.67 
 
 
400 aa  338  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  40.94 
 
 
386 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  31.41 
 
 
343 aa  159  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  31.29 
 
 
343 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
343 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
381 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  32.32 
 
 
374 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  32.8 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  29.56 
 
 
400 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
378 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
377 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.52 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  27.05 
 
 
373 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
376 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
386 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.76 
 
 
374 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.46 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
374 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.76 
 
 
374 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.04 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  26.44 
 
 
374 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
373 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
374 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
408 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  27.38 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.27 
 
 
374 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 
378 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
374 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.34 
 
 
374 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.81 
 
 
374 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.85 
 
 
390 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
374 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  26.51 
 
 
373 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.08 
 
 
374 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  27.08 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  27.08 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.08 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
373 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
374 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  32.24 
 
 
392 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
394 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  25.17 
 
 
364 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
391 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
394 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
394 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
391 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
370 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
401 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
391 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
409 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
409 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  31.36 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
415 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
374 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
410 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.98 
 
 
405 aa  92  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.01 
 
 
394 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.01 
 
 
394 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
453 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  33.03 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
372 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
446 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
413 aa  89.7  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
403 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
419 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
390 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>