More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2938 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 351 aa  714    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  42.66 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0264  phosphatidylserine decarboxylase  44.9 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  37.24 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  39.6 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  35.71 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 		 750 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25.15 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.15 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  25.15 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 739 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  25.15 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.91 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.15 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  30.99 
 
 		 400 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 660 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.73 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.47 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  23.28 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  27.87 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  24.5 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 378 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 		 374 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  25.17 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 387 aa  93.2  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.34 
 
 		 366 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 391 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.08 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.76 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 399 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 536 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 		 453 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  24.59 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.07 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.95 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  35.2 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  35.93 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  38.61 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.36 
 
 		 388 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.24 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.25 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>