More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4202 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 364 aa  749    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  43.25 
 
 		 367 aa  311  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 		 359 aa  305  6e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 		 364 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  32.12 
 
 		 468 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  28.04 
 
 		 383 aa  86.7  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  21.22 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.64 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  31.38 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.95 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  22.95 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  22.95 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  22.95 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.95 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  24.15 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.95 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  24.85 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 821 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  30.77 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 		 419 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 819 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.29 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.42 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 821 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.82 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 822 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  23.53 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.88 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  32.86 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.66 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  21.95 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.88 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  24.56 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.33 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  44.33 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  44.33 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>