More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3034 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
360 aa  724    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.39 
 
 
365 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.19 
 
 
366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.28 
 
 
363 aa  258  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
377 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
377 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
361 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
378 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 
419 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
398 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
379 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.65 
 
 
365 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
383 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
403 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
374 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
403 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
374 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
364 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  30.85 
 
 
395 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
398 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
366 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.76 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
387 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
371 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
390 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
388 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  31.42 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.66 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.62 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
360 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
402 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
393 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
372 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
345 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
374 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  27.47 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
370 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
408 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.53 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  24.73 
 
 
745 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
380 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
398 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
399 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
389 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.7 
 
 
468 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
386 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
381 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
374 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
414 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
396 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
395 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  27.61 
 
 
342 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
408 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
373 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
370 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
536 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
412 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
377 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
364 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
391 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
392 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
357 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
390 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.76 
 
 
745 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
396 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
395 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
366 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.8 
 
 
411 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  25.25 
 
 
383 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
380 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
378 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
374 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
379 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
389 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>