More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1108 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
357 aa  720    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.82 
 
 
355 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  43.51 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  41.64 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0330  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
377 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
360 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
401 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
393 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
361 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
377 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
381 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
377 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
398 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.13 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
382 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 
374 aa  95.9  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.63 
 
 
385 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.23 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.85 
 
 
346 aa  89.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  23.13 
 
 
350 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
377 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
414 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.1 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
384 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
374 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
399 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
370 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
405 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
388 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.17 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0604  a-glycosyltransferase  25.22 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.55 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.16 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  22.16 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.16 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  22.16 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
390 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.16 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  27.42 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.49 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  24.78 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.92 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  21.93 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.45 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  22.89 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.34 
 
 
745 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  27.72 
 
 
408 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  38.2 
 
 
453 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
426 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.94 
 
 
778 aa  78.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  21.56 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  23.05 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
406 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.65 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
410 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>