205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0330 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0330  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
368 aa  716    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
374 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.29 
 
 
355 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2276  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.61 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  21.61 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  21.61 
 
 
366 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.55 
 
 
366 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  24.23 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  21.61 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  24.23 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25 
 
 
406 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25 
 
 
406 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
382 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
398 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  28.8 
 
 
557 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  39.62 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  28 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.48 
 
 
406 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.62 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
406 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
406 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.48 
 
 
406 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.44 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
750 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
384 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
430 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
374 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
408 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.06 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 
569 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
739 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.89 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
374 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.28 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.85 
 
 
406 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.08 
 
 
406 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  20.86 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
452 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
394 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
405 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
402 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
388 aa  49.7  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
369 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  41.03 
 
 
775 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
344 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.25 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.54 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.51 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.25 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.4 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  22.51 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>