More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1116 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  100 
 
 		 413 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  99.03 
 
 		 413 aa  808    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  45.88 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 		 419 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  37.05 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  35.97 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  35.6 
 
 		 414 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  37.54 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.34 
 
 		 778 aa  136  6.0000000000000005e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  38.83 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 539 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  29.44 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.61 
 
 		 401 aa  109  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  30.52 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 782 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  30.9 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 733 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 403 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  23.8 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 462 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.06 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 748 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 768 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 904 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  44.36 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0141  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.75 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.89 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>