More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4708 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 418 aa  853    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  75.12 
 
 		 419 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  45.88 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  45.36 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  39.05 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  36.74 
 
 		 414 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 		 440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.71 
 
 		 778 aa  146  7.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 447 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 782 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  30.2 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  28.78 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  27.88 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 539 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  30.17 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 404 aa  93.6  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 733 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 398 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 1220 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29460  Glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.565576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 1303 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  23.33 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.54 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  24.66 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4717  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 893 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.337059  normal  0.0164521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  25.14 
 
 		 1147 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.39 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>