More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4364 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  770    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  75.07 
 
 
391 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  75.07 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  45.65 
 
 
384 aa  319  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  47.23 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  42.71 
 
 
391 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  41.34 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  43.51 
 
 
404 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  39.75 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
401 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  38.21 
 
 
392 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
403 aa  215  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
403 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
404 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 
398 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 
403 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
409 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.75 
 
 
401 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
435 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
387 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
445 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
426 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
414 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
402 aa  169  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
415 aa  166  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
415 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  29.82 
 
 
401 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
418 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
386 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  33.99 
 
 
413 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
405 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
413 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
539 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 
421 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  30.82 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
423 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
440 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  39.21 
 
 
398 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  38.57 
 
 
353 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  30.65 
 
 
403 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
403 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
419 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
424 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
409 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
353 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
346 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 
401 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
422 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
356 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  49.02 
 
 
381 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
355 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
421 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
447 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
373 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
422 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  37.56 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
904 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
394 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.55 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
400 aa  93.2  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
414 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  42.33 
 
 
411 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  35.5 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
373 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  23.73 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
360 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.91 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
355 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
389 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.35 
 
 
407 aa  89.7  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  28.79 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
440 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 
414 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.7 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 
369 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  38.76 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  33.5 
 
 
404 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
372 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  39.04 
 
 
434 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>