More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3530 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
385 aa  762    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.8 
 
 
350 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
409 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
381 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
378 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
360 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
396 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  43.05 
 
 
398 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  34.53 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
351 aa  96.3  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.5 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
379 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
400 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  34.83 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
355 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
355 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
568 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
395 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
373 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  38.39 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.69 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
392 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.52 
 
 
400 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
386 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  31.76 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
430 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
403 aa  86.7  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
418 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.7 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  38.55 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.64 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  31.53 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  37.67 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
810 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
507 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  32.57 
 
 
638 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  32.2 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  42.34 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>