More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0178 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
414 aa  825    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  42.41 
 
 
445 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.34 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
401 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
403 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  32.75 
 
 
403 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
412 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2863  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2864  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
397 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
445 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
403 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
924 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  28.3 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
436 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
452 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  29.72 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.49 
 
 
778 aa  81.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
539 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  28.27 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
871 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  40.65 
 
 
422 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  29.46 
 
 
468 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  28.9 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29460  Glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.565576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
816 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  25.49 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  24.85 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  27.78 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
1303 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
409 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  22.51 
 
 
1147 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>