More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4356 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 409 aa  830    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  73.25 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  66.25 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  54.48 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  52.8 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  42.36 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 		 415 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 403 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  37.09 
 
 		 401 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 403 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  32.43 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  32 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 426 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 404 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  39.15 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  31.84 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  30.49 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.26 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  31.07 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 353 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.6 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 		 401 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 424 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 		 346 aa  92.8  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.64 
 
 		 778 aa  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.53 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 539 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  37.85 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.88 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  38.76 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.42 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  35.91 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>