More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0082 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 403 aa  827    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  100 
 
 		 403 aa  827    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.45 
 
 		 397 aa  323  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 414 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2863  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2864  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  29.44 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 445 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  28.91 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  26.2 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 452 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 733 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 424 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 393 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.55 
 
 		 778 aa  95.5  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  26.77 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 1303 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 426 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 430 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 440 aa  86.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 782 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.33 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 1301 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.48 
 
 		 745 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 924 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.92 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  31.91 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>