More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2716 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
733 aa  1496    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  51 
 
 
436 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  45.21 
 
 
452 aa  382  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  46.53 
 
 
466 aa  354  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  52.61 
 
 
281 aa  273  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  37.59 
 
 
288 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
452 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
447 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
445 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
441 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
782 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.85 
 
 
778 aa  116  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
414 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
440 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
539 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  26.65 
 
 
425 aa  108  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
440 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
425 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
413 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.75 
 
 
403 aa  97.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
403 aa  97.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  28.97 
 
 
413 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
418 aa  92.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  25.22 
 
 
442 aa  92  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
2046 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
428 aa  87  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
409 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
411 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
1303 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
854 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
415 aa  79  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.67 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  28 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
391 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6490  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
414 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632954  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1125  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
414 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
445 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
357 aa  73.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.35 
 
 
385 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.22 
 
 
407 aa  72  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.41 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.91 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
462 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
367 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
353 aa  70.5  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
366 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
424 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
410 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.31 
 
 
1867 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
1301 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.98 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  30.69 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.12 
 
 
380 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
353 aa  67  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
374 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  18.54 
 
 
442 aa  67.4  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
403 aa  67.4  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
392 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 
397 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
353 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
406 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.51 
 
 
404 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
427 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
394 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
371 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
375 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  26.92 
 
 
342 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
408 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
1067 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
426 aa  65.1  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
396 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>