More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0642 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
463 aa  948    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  44.9 
 
 
468 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  42.74 
 
 
471 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  48.72 
 
 
412 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 
502 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.33 
 
 
473 aa  276  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.12 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  33.97 
 
 
467 aa  268  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
504 aa  250  5e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  30.06 
 
 
550 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  30.08 
 
 
507 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  29.26 
 
 
500 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
538 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
550 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  30.24 
 
 
503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  30.26 
 
 
529 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
540 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
503 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
570 aa  229  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
526 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
516 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  30.26 
 
 
529 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
507 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
503 aa  223  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
527 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
503 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
512 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
500 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
568 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  37.7 
 
 
606 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  25.05 
 
 
486 aa  162  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
505 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
487 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
372 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
360 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
371 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
371 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
435 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
377 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
391 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
381 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
365 aa  90.9  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
434 aa  90.9  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
438 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
371 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
439 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  29.58 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
377 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.31 
 
 
650 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
401 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
360 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
438 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
438 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
495 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
499 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.19 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.19 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
385 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.19 
 
 
498 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
393 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
384 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
390 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
363 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
399 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
381 aa  86.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  28.65 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
374 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
384 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.32 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02955  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07860)  26.89 
 
 
2880 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.23 
 
 
365 aa  84  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
396 aa  84  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
398 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.32 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>