More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1367 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  44.02 
 
 
1220 aa  959    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  80.69 
 
 
1303 aa  2062    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  46.96 
 
 
1265 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  47.41 
 
 
1271 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1301 aa  2602    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  50.91 
 
 
1239 aa  1092    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  49.04 
 
 
1292 aa  1062    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  34.15 
 
 
1147 aa  523  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  51.56 
 
 
1867 aa  406  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
924 aa  327  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  29.03 
 
 
1608 aa  322  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 
404 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 
404 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
740 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
740 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
732 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
1476 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
828 aa  106  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
953 aa  104  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
1067 aa  102  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
539 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
673 aa  98.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
441 aa  93.6  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.4 
 
 
2401 aa  90.1  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
418 aa  84  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
733 aa  83.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.41 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
436 aa  80.9  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
452 aa  80.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
384 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
445 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.5 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
413 aa  74.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
1400 aa  72.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
386 aa  71.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
782 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
419 aa  70.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
452 aa  70.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
1059 aa  69.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  44 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
414 aa  68.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
391 aa  68.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
1035 aa  67  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 
393 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
445 aa  65.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  21.96 
 
 
778 aa  65.9  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3945  hypothetical protein  39.64 
 
 
547 aa  65.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
445 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  26.09 
 
 
372 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
390 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
397 aa  63.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 
425 aa  63.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  30.13 
 
 
331 aa  62.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.6 
 
 
377 aa  62.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.02 
 
 
390 aa  62.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
394 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
816 aa  62.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  23.53 
 
 
425 aa  62.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
392 aa  62.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
411 aa  62  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
466 aa  62  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  28.03 
 
 
413 aa  61.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.82 
 
 
387 aa  61.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  17.79 
 
 
442 aa  61.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 
401 aa  61.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
413 aa  61.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.68 
 
 
404 aa  60.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  30.59 
 
 
1121 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.73 
 
 
397 aa  60.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
814 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
375 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  49.3 
 
 
380 aa  60.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 
400 aa  59.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
408 aa  58.9  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
403 aa  58.9  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  40.66 
 
 
384 aa  58.9  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  26.71 
 
 
384 aa  58.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  50.75 
 
 
377 aa  58.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
407 aa  58.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
377 aa  58.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
377 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
428 aa  58.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
369 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
354 aa  58.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
376 aa  58.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
354 aa  57.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
378 aa  58.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  43.33 
 
 
372 aa  57  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  44.19 
 
 
379 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
354 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  29.82 
 
 
378 aa  57.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  41.05 
 
 
354 aa  57.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
354 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
1317 aa  57  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
381 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  27.54 
 
 
342 aa  57  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>