More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0478 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 442 aa  872    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  19.78 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  19.28 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  19.76 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  20.83 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  18.25 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  23.82 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  20.68 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  20.82 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  17.85 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  23.81 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  18.6 
 
 		 733 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.36 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  18.49 
 
 		 1303 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  21.17 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.79 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  17.93 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  20.22 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  20.75 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  20.06 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  19.4 
 
 		 1220 aa  63.2  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  20.38 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  30.1 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.68 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  16.5 
 
 		 746 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  18.01 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.67 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  17.24 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  17.3 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21.58 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.6 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  19.63 
 
 		 1059 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  17.48 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.6 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  21.34 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  19.37 
 
 		 1035 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  24.22 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.17 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  24.58 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  19.14 
 
 		 1067 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  20.43 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  18.13 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  28.57 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1914  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  19.75 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  20.55 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  17.25 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1816  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  27.06 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  20.81 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  24.88 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  20.14 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  21.77 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 351 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  18.4 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  16.84 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>