More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2368 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 409 aa  833    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  44.66 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  39.37 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  30.29 
 
 		 420 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3341  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  29.3 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  29.06 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  28.31 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 415 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  32.09 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  29.78 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2150  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  42.31 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 639 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  23.86 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 660 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6549  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  31.79 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1760  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1433  glycosyltransferase  27.44 
 
 		 570 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  31.43 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.64 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  35 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  41.3 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.74 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.95 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.95 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.34 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.98 
 
 		 380 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.63 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  38.2 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  25.7 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  30.63 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  30.39 
 
 		 374 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3700  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.98 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  34.09 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2942  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  43.84 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>