More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6341 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 354 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  62.91 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  49.18 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  48.53 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  44.63 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 380 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 384 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  36.2 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 376 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  33.33 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  34.01 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 377 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  31.61 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 371 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0743  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0554251  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.08 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.08 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  26.71 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 435 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 370 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 361 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 380 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.21 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  25.69 
 
 		 364 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 437 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 381 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 423 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 		 364 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  37.87 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  28.65 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.58 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  27.58 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.13 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 370 aa  99.8  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  22.07 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  41.44 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  22.07 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 		 414 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>