More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1784 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  100 
 
 		 401 aa  828    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  33.08 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.95 
 
 		 401 aa  216  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 403 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  29.97 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.35 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  38.38 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  30.9 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.77 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 418 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.46 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 369 aa  89.4  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  29.05 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  42.14 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.82 
 
 		 778 aa  87.8  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  32.34 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.11 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.08 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  27.5 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.23 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.67 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  29.39 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  21.56 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.11 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  28.27 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>