More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2213 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
395 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  48.23 
 
 
404 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
433 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
346 aa  143  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
430 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
367 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
367 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
390 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
391 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
371 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 
816 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  35.71 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.6 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
436 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
419 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.65 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
507 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
415 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
377 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
390 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
367 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 
425 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  35.84 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  37.27 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
408 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
405 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
367 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
377 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
422 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 
371 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
409 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
381 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
398 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  39.56 
 
 
413 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
367 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
377 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
372 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  37.92 
 
 
375 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 
810 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
405 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.5 
 
 
379 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 
351 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  22.16 
 
 
355 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
453 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
355 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  38.43 
 
 
395 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
421 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.63 
 
 
377 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  36.54 
 
 
803 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
410 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 
381 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
386 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.97 
 
 
935 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
396 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
391 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
382 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
385 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
381 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
390 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
396 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
424 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
430 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
370 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
418 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
348 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
393 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
387 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
401 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
360 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
372 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
376 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  42.08 
 
 
750 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
819 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
355 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  39.18 
 
 
403 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
382 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.67 
 
 
404 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
435 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
380 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>