More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1507 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
395 aa  779    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  47.45 
 
 
373 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 
904 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 
394 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
378 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  39.27 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  43.01 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
383 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
383 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
377 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
367 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
417 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  32.46 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.99 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
401 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
417 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
355 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
385 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  32.48 
 
 
419 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 
421 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
364 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
410 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
355 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
355 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 
374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
376 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
381 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
383 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  37.55 
 
 
413 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
412 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.9 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  38.08 
 
 
399 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
422 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
380 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.76 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.76 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.76 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  35.48 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  32.98 
 
 
406 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  32.98 
 
 
406 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 
381 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
406 aa  113  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
411 aa  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
378 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  39.63 
 
 
408 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
394 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  41.85 
 
 
351 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
406 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  35.08 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  35.48 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  39.32 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.68 
 
 
406 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
439 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
401 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  35.08 
 
 
406 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
394 aa  110  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
374 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
425 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
383 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.02 
 
 
406 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
382 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
419 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
360 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
406 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
415 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
378 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
373 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
406 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.61 
 
 
406 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
385 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  34.33 
 
 
411 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
430 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>