More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0126 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
371 aa  748    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  83.19 
 
 
398 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  57.51 
 
 
355 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  62.92 
 
 
351 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
413 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  39.61 
 
 
347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  40.41 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
373 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
770 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  39.44 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  29.07 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
435 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
382 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.41 
 
 
388 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
374 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
399 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
446 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  34.45 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.97 
 
 
351 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.65 
 
 
935 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
414 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.5 
 
 
382 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
411 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  28.27 
 
 
382 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.91 
 
 
382 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
392 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
369 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
408 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
408 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
408 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
359 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  39.11 
 
 
402 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
375 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
380 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
374 aa  106  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
440 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
380 aa  106  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
385 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
369 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
384 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  36.64 
 
 
426 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  27.37 
 
 
471 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
415 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
421 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
360 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
396 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  29.02 
 
 
421 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
370 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
385 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  34.45 
 
 
426 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  30 
 
 
421 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
406 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
536 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  36.1 
 
 
373 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
398 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
414 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
377 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.04 
 
 
409 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
383 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
421 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.71 
 
 
407 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  26.68 
 
 
379 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
379 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.6 
 
 
375 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
377 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
452 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 
370 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  30.6 
 
 
375 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
373 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
382 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
388 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 
364 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  39.81 
 
 
367 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
375 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
404 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
386 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
399 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
427 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
375 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
375 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
400 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  35.22 
 
 
388 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
419 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 
370 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
412 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
371 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>