More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0380 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
391 aa  808    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
419 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  35.49 
 
 
420 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
386 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
408 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 
412 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  29.06 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
415 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  29.12 
 
 
387 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
372 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2971  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
391 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.176769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2879  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
385 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.658622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
409 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
382 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
904 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  27.57 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
810 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3341  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178171  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
392 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
369 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2150  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
365 aa  93.6  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
378 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  29.5 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
748 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
355 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
367 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  24.34 
 
 
416 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
410 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
353 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
346 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.84 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
419 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
381 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
355 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
377 aa  86.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
536 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.29 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  22.88 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  25.21 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.41 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.42 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  25.22 
 
 
803 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.1 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  22.83 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.05 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  24.86 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.43 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6548  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>