More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0458 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
447 aa  907    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  50.68 
 
 
445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  51.03 
 
 
441 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
452 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
452 aa  187  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
466 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
733 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  28.35 
 
 
778 aa  166  8e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
414 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
440 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  32.56 
 
 
425 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  30.56 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
462 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
539 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
440 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
782 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
403 aa  126  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
403 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  30.05 
 
 
403 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
403 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
428 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
401 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.03 
 
 
401 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.4 
 
 
397 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
415 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
413 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
1303 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
394 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
401 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
924 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
391 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
414 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.31 
 
 
1867 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  26.1 
 
 
384 aa  89  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
402 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
1265 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
1271 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
395 aa  86.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
391 aa  86.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.76 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
393 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  28.54 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
1239 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
1220 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
753 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  19.51 
 
 
442 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
1067 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
367 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  22.6 
 
 
442 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
1301 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.5 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
403 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
410 aa  77  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
550 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4404  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983503  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  26.32 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>