More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5722 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  65.46 
 
 
1292 aa  1456    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  68.66 
 
 
1239 aa  1557    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  49.65 
 
 
1301 aa  1093    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  50.44 
 
 
1303 aa  1113    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  91.02 
 
 
1265 aa  1997    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1271 aa  2484    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  46.03 
 
 
1220 aa  992    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.5 
 
 
1867 aa  546  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  35.64 
 
 
1147 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
924 aa  327  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  29.94 
 
 
1608 aa  321  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 
404 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 
404 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
740 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
740 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
732 aa  190  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
828 aa  125  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
441 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
673 aa  102  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
953 aa  97.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
447 aa  95.1  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
539 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
384 aa  91.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
1067 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
386 aa  86.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
1476 aa  83.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.75 
 
 
2401 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  27.86 
 
 
425 aa  77  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.28 
 
 
403 aa  76.3  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
403 aa  76.3  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3945  hypothetical protein  36.89 
 
 
547 aa  75.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
418 aa  74.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  20.17 
 
 
778 aa  68.9  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
733 aa  67.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
440 aa  67.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
397 aa  66.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  29.28 
 
 
1121 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
445 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
392 aa  65.9  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
428 aa  64.3  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
391 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
440 aa  63.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
1400 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
390 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  29.95 
 
 
413 aa  62.4  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
466 aa  61.6  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.81 
 
 
366 aa  60.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
810 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
414 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
364 aa  60.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
445 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
535 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
359 aa  59.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
413 aa  59.3  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
814 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
361 aa  59.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  27.72 
 
 
414 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
417 aa  58.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
436 aa  58.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3902  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
342 aa  58.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
367 aa  58.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
871 aa  58.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
391 aa  58.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  27.67 
 
 
331 aa  58.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  24.34 
 
 
401 aa  58.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  32.63 
 
 
402 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
377 aa  57.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
782 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
405 aa  57.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
421 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
820 aa  56.2  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
393 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
434 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
403 aa  56.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  30 
 
 
398 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
364 aa  55.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.65 
 
 
354 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.65 
 
 
354 aa  55.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.65 
 
 
354 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  42.65 
 
 
354 aa  55.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.65 
 
 
354 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.65 
 
 
354 aa  55.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.65 
 
 
354 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.65 
 
 
354 aa  55.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
410 aa  55.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  21.82 
 
 
401 aa  55.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
1317 aa  55.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  42.65 
 
 
354 aa  55.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 
354 aa  55.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  42.65 
 
 
354 aa  55.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  42.65 
 
 
354 aa  55.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  42.65 
 
 
354 aa  55.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 
354 aa  55.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  30.23 
 
 
361 aa  55.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 
354 aa  54.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.48 
 
 
377 aa  54.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
371 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
413 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>