194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1347 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
367 aa  751    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  83.15 
 
 
364 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  38.15 
 
 
359 aa  226  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  36.99 
 
 
355 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.6 
 
 
366 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  39.19 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  36.01 
 
 
360 aa  210  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  38.66 
 
 
359 aa  209  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
354 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  36.19 
 
 
361 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
368 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  35.67 
 
 
352 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
357 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  29.95 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
371 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  28.38 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  29.1 
 
 
384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
354 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  27.2 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  25.9 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  28.52 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
390 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.45 
 
 
2401 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  28 
 
 
1444 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  24.3 
 
 
1121 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
828 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
953 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
1292 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
550 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
1239 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  30.36 
 
 
1147 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  21.57 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  38.18 
 
 
402 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
1271 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
1265 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
1303 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
405 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  39.77 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
402 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  31.46 
 
 
1608 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  25.32 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
924 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
1220 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  32.71 
 
 
371 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
740 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
740 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
410 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
427 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  36.84 
 
 
404 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4455  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
430 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  33.02 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
1301 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4434  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
430 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  30.77 
 
 
391 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  31.13 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  36.11 
 
 
557 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
418 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
425 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
351 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
428 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
423 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
417 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  19.41 
 
 
344 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
417 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
372 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  18.39 
 
 
399 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  39.53 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
1476 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  23.79 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  39.06 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.39 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
458 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>