More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0667 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
360 aa  743    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  57.42 
 
 
361 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  54.44 
 
 
359 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  50.42 
 
 
359 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.72 
 
 
366 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  47.08 
 
 
356 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  43.79 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  45.07 
 
 
352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  42.82 
 
 
357 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  43.85 
 
 
361 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  44.69 
 
 
372 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  40.11 
 
 
354 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
368 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  33.81 
 
 
331 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
371 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  28.14 
 
 
361 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  28.91 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  28.25 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  26.96 
 
 
333 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.68 
 
 
2401 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  28.35 
 
 
1147 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
360 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
415 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
377 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  29.6 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  24.63 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  22.75 
 
 
1121 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  26.63 
 
 
1608 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
366 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
367 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
828 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.41 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0077  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0147  helix-turn-helix, AraC type  31.29 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.586642  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  26.24 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  23.32 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.63 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
507 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
1303 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
456 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.02 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.62 
 
 
381 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
376 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.02 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.02 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.02 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.02 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.02 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  25 
 
 
456 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  25 
 
 
456 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0155  hypothetical protein  23.89 
 
 
928 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.09 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
373 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.62 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  24.58 
 
 
399 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  27.23 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
365 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
274 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
348 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
763 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
324 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  26.83 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
405 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>