More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0722 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
357 aa  724    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  57.55 
 
 
360 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  53.71 
 
 
348 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  57.93 
 
 
344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  54.65 
 
 
349 aa  353  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  59.08 
 
 
344 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  57.06 
 
 
344 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  49.43 
 
 
351 aa  308  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
362 aa  293  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  48.04 
 
 
367 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  47.88 
 
 
352 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  46.49 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  44.07 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  44.07 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  42.09 
 
 
352 aa  258  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  44.93 
 
 
348 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.39 
 
 
362 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  35.65 
 
 
364 aa  222  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
358 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  35.14 
 
 
349 aa  209  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
377 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
394 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
422 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 
366 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  32.31 
 
 
443 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  32.38 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
377 aa  96.3  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  34.23 
 
 
480 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  33.82 
 
 
450 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
381 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  30.73 
 
 
428 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  25.27 
 
 
382 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  32.2 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
376 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.14 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
425 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
434 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
393 aa  89.4  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
453 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
448 aa  89.4  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
370 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  31.19 
 
 
388 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
419 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
346 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
402 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
439 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.84 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
436 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  31.78 
 
 
383 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
482 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
386 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
440 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
419 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
453 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.88 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  28.01 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.17 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  29.8 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  33.33 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.37 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.71 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
623 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>