26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0155 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0155  hypothetical protein  100 
 
 		 928 aa  1844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0142  hypothetical protein  95.8 
 
 		 928 aa  1718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  65.78 
 
 		 1121 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 		 1162 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 1213 aa  183  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1883  hypothetical protein  39.66 
 
 		 372 aa  172  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 1187 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0347  hypothetical protein  28.82 
 
 		 347 aa  105  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.337715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.56 
 
 		 2401 aa  98.6  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 525 aa  64.3  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1444 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  23.44 
 
 		 398 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  27.55 
 
 		 361 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  41.84 
 
 		 1292 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  22.36 
 
 		 361 aa  55.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 360 aa  52.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 1317 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  41.76 
 
 		 372 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  43.02 
 
 		 1239 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 1271 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 1265 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 		 368 aa  47.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 1297 aa  46.6  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 367 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  28.97 
 
 		 1147 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 953 aa  45.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>