102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4069 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
398 aa  827    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.92 
 
 
2401 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  27.64 
 
 
1121 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  28.19 
 
 
1444 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  27.04 
 
 
372 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2759  hypothetical protein  29.5 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
828 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0145  hypothetical protein  31.65 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156934  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
1317 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
1213 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
1192 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.21 
 
 
366 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  27.98 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  25.22 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  25.56 
 
 
361 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  25.2 
 
 
333 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
1359 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
352 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
1187 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
740 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
740 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
1190 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2617  hypothetical protein  29.08 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  27.43 
 
 
1608 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
924 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
1191 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  25.98 
 
 
340 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
1188 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  24.91 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
1198 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
1292 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  23 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0155  hypothetical protein  23.44 
 
 
928 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  24.48 
 
 
1147 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  22.81 
 
 
331 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
1271 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
1265 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  24.57 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
1239 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
1177 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 
1193 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  23.64 
 
 
339 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  24.64 
 
 
355 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
354 aa  53.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
399 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0142  hypothetical protein  23.44 
 
 
928 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
1301 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
1162 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
385 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1502  hypothetical protein  32.91 
 
 
344 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  26.26 
 
 
1171 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
812 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  26.63 
 
 
1165 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  26.63 
 
 
1165 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4067  glycosyl transferase  21.99 
 
 
1076 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
673 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
1759 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  22.22 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.22 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3082  hypothetical protein  33.73 
 
 
397 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726068  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
953 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.19 
 
 
385 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
819 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  26.34 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  25.44 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0986  hypothetical protein  29.46 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
762 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
810 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
660 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  26.52 
 
 
421 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  29.13 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
365 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
1220 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
419 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
367 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>