32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0145 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0145  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156934  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  24.69 
 
 
372 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  31.65 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  36.72 
 
 
2401 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
1193 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
1213 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
1187 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
1177 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
1359 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
1188 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  25.11 
 
 
1171 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  22.55 
 
 
341 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  26.42 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
1192 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  27.27 
 
 
1444 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.89 
 
 
1191 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
1317 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
1190 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  21 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
1198 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
828 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
1301 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2759  hypothetical protein  22.49 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  19 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  24.76 
 
 
1165 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  24.76 
 
 
1165 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
372 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  24.18 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  21.08 
 
 
386 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
1759 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  24.73 
 
 
1147 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>