276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3645 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
386 aa  755    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  42.05 
 
 
384 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
828 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
953 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
1476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
924 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
740 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
740 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
1265 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
1271 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
1220 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  25.97 
 
 
1608 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  26.57 
 
 
1147 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
673 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.48 
 
 
2401 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  40.71 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
1303 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
1292 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
1239 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  25.24 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  39.81 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  35.51 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
1301 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  36.84 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  38.83 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  30.6 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  23.03 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  26.06 
 
 
1121 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  37 
 
 
1444 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  43.81 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  38.39 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.03 
 
 
1191 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
358 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  23.72 
 
 
355 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
581 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
1190 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  37.96 
 
 
356 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  35.96 
 
 
333 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
357 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  29.31 
 
 
341 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.64 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
1198 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
732 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1400  hypothetical protein  23.93 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  34.38 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 
414 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
1213 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  39.08 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  31.28 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  41.3 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.56 
 
 
249 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  38.24 
 
 
340 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  38.82 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  37.78 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1502  hypothetical protein  25.41 
 
 
344 aa  53.5  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
348 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.33 
 
 
394 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.96 
 
 
381 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  41.56 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.95 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.66 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.96 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
342 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
390 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.96 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  38.96 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  38.96 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.96 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  42.68 
 
 
439 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3347  glycosyl transferase, group 1  43.21 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
409 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
376 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
390 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1356  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
609 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2910  glycosyl transferase group 1  40.79 
 
 
418 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.168216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>