More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2728 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 372 aa  755    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  62.54 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  59.04 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  48.47 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  49.45 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.76 
 
 		 366 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  47.84 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  44.69 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  47.63 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  43.8 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  38.7 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  32.35 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  32.29 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  31.1 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  28.45 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  26.24 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.02 
 
 		 2401 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1444 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 550 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  27.7 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  31.82 
 
 		 1147 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  27.59 
 
 		 1608 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 		 1476 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  24.08 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  22.84 
 
 		 1121 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  25.2 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 740 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 740 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.66 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.13 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  21.53 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 382 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1760  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.44 
 
 		 396 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 390 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  19.23 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.27 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  30.97 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  21.33 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 1190 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.31 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 924 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 516 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.54 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  22.56 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  28.74 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 355 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  20.16 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>