More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1539 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 431 aa  863    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  37.76 
 
 		 2401 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.95 
 
 		 423 aa  209  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  31.64 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  28.41 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  28.92 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 416 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  21.54 
 
 		 746 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 		 379 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.13 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 718 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  33.15 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.14 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2121  glycosyltransferase-like protein  24.39 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.41241  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.07 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  31.17 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  32.57 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  33.62 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.91 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  34.08 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 820 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2630  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.49 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  32.2 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.41 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  34.07 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  28.71 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  32.64 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  33.15 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>