More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4583 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 416 aa  853    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 746 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  33.13 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  28.66 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 422 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.15 
 
 		 2401 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  25.45 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 718 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.11 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 457 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  27.16 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  26.84 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2339  putative glycosyl transferase  24.64 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.225754  normal  0.701653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2238  putative glycosyl transferase  24.4 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2346  putative glycosyl transferase  24.4 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.31761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  23.12 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  23.12 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2671  putative glycosyl transferase  22.58 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  23.51 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.91 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  22.5 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  26.69 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2453  putative glycosyl transferase  24.4 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.449849  normal  0.0475636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 819 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2295  putative glycosyl transferase  25.42 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0600773  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.18 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  25.69 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  25.69 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  33.67 
 
 		 638 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1005  putative glycosyl transferase  22.19 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  32.58 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2350  putative glycosyl transferase  25.69 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  30.92 
 
 		 679 aa  77  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.41 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.29 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  26.73 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  32.41 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  25.67 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.36 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5392  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 662 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.632376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.86 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>