More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4786 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 414 aa  865    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  46.99 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  45.34 
 
 		 422 aa  360  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.86 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  35.28 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  35.33 
 
 		 2401 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  33.09 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 445 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  28.05 
 
 		 432 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  32.09 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  23.12 
 
 		 746 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.43 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.92 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 395 aa  91.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2121  glycosyltransferase-like protein  24.07 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.41241  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  25.41 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  25.82 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 718 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  25.87 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2350  putative glycosyl transferase  25.59 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2671  putative glycosyl transferase  24.48 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  25.59 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  25.59 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  25.59 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.07 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1005  putative glycosyl transferase  26.1 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.44 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2453  putative glycosyl transferase  25.87 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.449849  normal  0.0475636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5392  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.632376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  29.28 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  29.28 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.44 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2295  putative glycosyl transferase  25.64 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0600773  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2339  putative glycosyl transferase  25.12 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.225754  normal  0.701653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2346  putative glycosyl transferase  25.12 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.31761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2238  putative glycosyl transferase  25.12 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  27.85 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  28.38 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.44 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>