More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1311 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 426 aa  870    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  34.43 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.03 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 417 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  25.72 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 430 aa  89.7  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.31 
 
 		 2401 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  26.93 
 
 		 746 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  31.77 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  29.41 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  38.46 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.23 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  26.84 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  28.81 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1536  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.248937 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.69 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  29.09 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 718 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0290  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 820 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  27.88 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  26.52 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  34.82 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 		 404 aa  67  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 374 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  26.37 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  26.1 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.12 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  33.85 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.71 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.13 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 899 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>