More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3036 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 445 aa  931    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.54 
 
 		 2401 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 418 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.62 
 
 		 423 aa  190  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  33.44 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 417 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 417 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 412 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  30.75 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  25.39 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  21.52 
 
 		 746 aa  97.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 820 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 362 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 		 718 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  25.46 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  25.46 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  25.46 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  24.41 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2350  putative glycosyl transferase  25.46 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  25.34 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  25.46 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.95 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2671  putative glycosyl transferase  26.69 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1005  putative glycosyl transferase  24.18 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 827 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5392  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 662 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.632376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  31.11 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 871 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 812 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.06 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.61 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 770 aa  70.1  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  26.7 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  26.81 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6402  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  28.44 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  25.55 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>