More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0507 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
424 aa  831    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  43.1 
 
 
362 aa  289  7e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.47 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
406 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
424 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
430 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
412 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
420 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.65 
 
 
2401 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
417 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
441 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  23.83 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  44.86 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  46.23 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
748 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  35.27 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
418 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  43.3 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.22 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.22 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  48.04 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2339  putative glycosyl transferase  26.09 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.225754  normal  0.701653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2346  putative glycosyl transferase  26.09 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.31761  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  39.69 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.22 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.22 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  39.22 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  39.22 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  39.22 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.22 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.91 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  35.29 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 
440 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.17 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.22 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2238  putative glycosyl transferase  26.16 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  45.63 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.5 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  41.35 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.28 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2295  putative glycosyl transferase  25.75 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0600773  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2453  putative glycosyl transferase  26.49 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.449849  normal  0.0475636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  40.4 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  40.59 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  24.92 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  24.92 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  24.92 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  30.19 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  24.92 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  24.92 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  24.92 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>