More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1238 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  818    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  40.27 
 
 
378 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  41.53 
 
 
378 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  42.2 
 
 
379 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  43.73 
 
 
382 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.57 
 
 
381 aa  292  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.57 
 
 
381 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 
375 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  40 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  40 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  40 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  40.21 
 
 
387 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 
378 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  41.05 
 
 
378 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  40.91 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  41.42 
 
 
380 aa  285  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  41.8 
 
 
381 aa  285  9e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  40.7 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  40.27 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  39.84 
 
 
383 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  41.6 
 
 
381 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  41.27 
 
 
381 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  37.73 
 
 
380 aa  275  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  39.05 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
380 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 
379 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  40.64 
 
 
385 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  38.73 
 
 
377 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 
421 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 
374 aa  256  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
380 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
380 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
398 aa  252  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 
380 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 
370 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
426 aa  126  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  26.87 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
392 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.47 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
409 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
417 aa  113  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
355 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
394 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
392 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  40.14 
 
 
373 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
415 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
355 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
377 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  25.5 
 
 
426 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
355 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
360 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
382 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
412 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
364 aa  107  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
408 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
399 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.43 
 
 
351 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  26.08 
 
 
383 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
389 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
419 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
446 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
399 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
387 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
395 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
396 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
385 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  28.12 
 
 
416 aa  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
399 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
458 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  25.96 
 
 
350 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
439 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
396 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
376 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
377 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
387 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
370 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
353 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
390 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
422 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
414 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.17 
 
 
349 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
355 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
374 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
385 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>