More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2072 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  773    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  69.6 
 
 
378 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  65.24 
 
 
377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  58.56 
 
 
381 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  56.37 
 
 
379 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  57.07 
 
 
380 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  53.74 
 
 
379 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  54.32 
 
 
383 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  51.35 
 
 
382 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  49.09 
 
 
387 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 
378 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  47.35 
 
 
381 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.35 
 
 
381 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  47.35 
 
 
381 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  47.35 
 
 
381 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  47.35 
 
 
381 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.35 
 
 
381 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.35 
 
 
381 aa  345  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  45.62 
 
 
378 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.83 
 
 
381 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.09 
 
 
381 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  47.17 
 
 
381 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.56 
 
 
381 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  46.24 
 
 
375 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 
380 aa  333  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  45.6 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  45.09 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  46.63 
 
 
381 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  45.82 
 
 
383 aa  318  9e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  43.47 
 
 
380 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  43.47 
 
 
380 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  46.36 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 
384 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  40.8 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 
424 aa  306  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  38.57 
 
 
421 aa  305  6e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  43.5 
 
 
381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.55 
 
 
380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 
385 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 
394 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  38.93 
 
 
398 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 
370 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
387 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
410 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
385 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
415 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
390 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
395 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
536 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
426 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
399 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  23.58 
 
 
388 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
373 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
365 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
377 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
378 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
383 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
369 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
369 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
399 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.58 
 
 
371 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  24.61 
 
 
426 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
417 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
383 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
369 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
351 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
381 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
376 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
387 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
390 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
351 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
389 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
390 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
353 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
390 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
385 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
377 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
387 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
386 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
375 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
395 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.44 
 
 
371 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
371 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
385 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
373 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  27.43 
 
 
822 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
391 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
382 aa  99.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
387 aa  99.4  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.33 
 
 
411 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.85 
 
 
401 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>