More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0171 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 422 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  73.71 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  52.85 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 376 aa  327  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  51.76 
 
 		 373 aa  325  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  51.5 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  52.41 
 
 		 379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  49.47 
 
 		 376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  53.78 
 
 		 374 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  49.6 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  50.14 
 
 		 370 aa  302  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  49.2 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  47.06 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  47.06 
 
 		 375 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  47.06 
 
 		 375 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  48.13 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 		 374 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  42.67 
 
 		 390 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  47.37 
 
 		 384 aa  270  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  47.97 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  47.55 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 		 376 aa  259  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  42.97 
 
 		 385 aa  255  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  45.33 
 
 		 382 aa  249  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  49.19 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  45.07 
 
 		 378 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  45.93 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  42.44 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.95 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 770 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  29.52 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  30.5 
 
 		 383 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 373 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  32.4 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.9 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.45 
 
 		 770 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.48 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 810 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.66 
 
 		 404 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 359 aa  100  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  30.05 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  31.12 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.49 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  42.76 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.75 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 408 aa  97.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 387 aa  96.7  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 381 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  30.68 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  39.56 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  34.2 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.67 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.98 
 
 		 536 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>