More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1970 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  99.46 
 
 
370 aa  748    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
370 aa  750    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0406  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 
359 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0116053 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0230  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.46 
 
 
336 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 
371 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
371 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
377 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1197  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 
367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.788986  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
349 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  29.93 
 
 
408 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  33.59 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
369 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  21.39 
 
 
367 aa  89.7  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0474  phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  23.08 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  26.29 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
399 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.32 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  23.32 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
810 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  29.91 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  30 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.03 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  25.54 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  23.03 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.32 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
819 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  30 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  31.05 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  24.8 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  25.75 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.44 
 
 
745 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
821 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
816 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
744 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
821 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.08 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  19.78 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  23.22 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  25.35 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  21.38 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
819 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>