More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4075 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 744 aa  1519    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 		 756 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 		 773 aa  351  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4094  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 		 468 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537371  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.04 
 
 		 1177 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.04 
 
 		 1177 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 		 543 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1181  glycosyltransferase, group 1 family protein  28.25 
 
 		 579 aa  99  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.11 
 
 		 409 aa  97.8  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 379 aa  97.4  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 820 aa  96.3  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.39 
 
 		 388 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 386 aa  94  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 367 aa  94  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.87 
 
 		 407 aa  93.2  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.11 
 
 		 382 aa  91.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 378 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 381 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 409 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 368 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  37.17 
 
 		 426 aa  88.2  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 369 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  33.78 
 
 		 374 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 373 aa  87.8  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 416 aa  87.8  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 390 aa  87.8  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.11 
 
 		 349 aa  87.4  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.64 
 
 		 427 aa  87  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.5 
 
 		 401 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 385 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 396 aa  86.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  28.05 
 
 		 430 aa  87  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  27.37 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.12 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  28.7 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 424 aa  84  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 390 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.74 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 405 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.29 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.71 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  33.21 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.07 
 
 		 385 aa  80.5  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 370 aa  80.5  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2065  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 750 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 399 aa  80.5  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 350 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 507 aa  80.1  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  28.97 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.9 
 
 		 745 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  28.97 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.6 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  21.94 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  29.24 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  27.7 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  28.23 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  29.45 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>