More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2773 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 348 aa  693    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  64.41 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  68.1 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  67.84 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  68.1 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  59.77 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  53.71 
 
 		 357 aa  341  9e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  53.8 
 
 		 362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  53.04 
 
 		 351 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  52.29 
 
 		 352 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  51.74 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  48.16 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  48.16 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  49.56 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  48.75 
 
 		 352 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  42.73 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  44.57 
 
 		 348 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  36.71 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  36.6 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  36.81 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  33.52 
 
 		 364 aa  212  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 		 402 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 434 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  33.6 
 
 		 427 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.71 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  37.69 
 
 		 417 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  35.52 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 672 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 		 436 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 		 421 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 426 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 381 aa  95.9  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 422 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 410 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 452 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.82 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.94 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.6 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 426 aa  94  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 439 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.8 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 440 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 439 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 439 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 361 aa  92.4  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  35.71 
 
 		 480 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  31.01 
 
 		 442 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  30.4 
 
 		 426 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  27.32 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  34.34 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  33.74 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 437 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5392  glycosyl transferase group 1  36.82 
 
 		 662 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.632376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 437 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.05 
 
 		 424 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 438 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 		 439 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  31.65 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>