More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3740 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  100 
 
 		 349 aa  720    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  54.87 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  52.92 
 
 		 358 aa  360  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  48.41 
 
 		 362 aa  325  8.000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  40.18 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.25 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  35.61 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  34.78 
 
 		 349 aa  195  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  35.63 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  35.63 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  35.45 
 
 		 344 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  31.87 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 748 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.74 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  31.76 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.23 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  25.53 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.19 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  23.91 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  23.13 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.98 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  27.64 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 756 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.53 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  27.6 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 526 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.47 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  23.19 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0612  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.76 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.5 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  20.65 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>